Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNT2Q6UVM3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNT2Q6UVM3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms