Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN5Q6U736 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN5Q6U736 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN5Q6U736 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN5Q6U736 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN5Q6U736 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN5Q6U736 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN5Q6U736 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN5Q6U736 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN5Q6U736 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN5Q6U736 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN5Q6U736 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN5Q6U736 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
OPN5Q6U736 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
OPN5Q6U736 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OPN5Q6U736 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OPN5Q6U736 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
OPN5Q6U736 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
OPN5Q6U736 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
OPN5Q6U736 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms