Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOA5Q6Q788 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
APOA5Q6Q788 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
APOA5Q6Q788 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms