Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL18

ATAD2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2Q6PL18 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATAD2Q6PL18 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATAD2Q6PL18 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATAD2Q6PL18 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATAD2Q6PL18 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATAD2Q6PL18 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATAD2Q6PL18 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATAD2Q6PL18 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATAD2Q6PL18 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATAD2Q6PL18 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATAD2Q6PL18 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATAD2Q6PL18 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
ATAD2Q6PL18 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATAD2Q6PL18 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATAD2Q6PL18 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATAD2Q6PL18 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
ATAD2Q6PL18 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
ATAD2Q6PL18 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC31■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC31■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ATAD2Q6PL18 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATAD2Q6PL18 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATAD2Q6PL18 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATAD2Q6PL18 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATAD2Q6PL18 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATAD2Q6PL18 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATAD2Q6PL18 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATAD2Q6PL18 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATAD2Q6PL18 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ATAD2Q6PL18 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATAD2Q6PL18 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATAD2Q6PL18 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATAD2Q6PL18 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATAD2Q6PL18 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATAD2Q6PL18 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ATAD2Q6PL18 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATAD2Q6PL18 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATAD2Q6PL18 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATAD2Q6PL18 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATAD2Q6PL18 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATAD2Q6PL18 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATAD2Q6PL18 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATAD2Q6PL18 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATAD2Q6PL18 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATAD2Q6PL18 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ATAD2Q6PL18 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATAD2Q6PL18 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ATAD2Q6PL18 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms