Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
CSAG1Q6PB30 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
CSAG1Q6PB30 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms