Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXR0

IRGC, Interferon-inducible GTPase 5, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGCQ6NXR0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRGCQ6NXR0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRGCQ6NXR0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRGCQ6NXR0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRGCQ6NXR0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRGCQ6NXR0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRGCQ6NXR0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRGCQ6NXR0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRGCQ6NXR0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRGCQ6NXR0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRGCQ6NXR0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRGCQ6NXR0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRGCQ6NXR0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRGCQ6NXR0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRGCQ6NXR0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRGCQ6NXR0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRGCQ6NXR0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRGCQ6NXR0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IRGCQ6NXR0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRGCQ6NXR0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IRGCQ6NXR0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IRGCQ6NXR0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms