Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUQ1

RINT1, RAD50-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RINT1Q6NUQ1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RINT1Q6NUQ1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RINT1Q6NUQ1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms