Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RALGAPA1Q6GYQ0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RALGAPA1Q6GYQ0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms