Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM68Q6AZZ1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM68Q6AZZ1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms