Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
INTS3Q68E01 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
INTS3Q68E01 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms