Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCTD16Q68DU8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD16Q68DU8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms