Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ECM29Q5VYK3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ECM29Q5VYK3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ECM29Q5VYK3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms