Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
WDR78Q5VTH9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms