Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SAPCD1Q5SSQ6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SAPCD1Q5SSQ6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms