Protein–RNA interactions for Protein: Q5PRF9

SAMD4B, Protein Smaug homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4BQ5PRF9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SAMD4BQ5PRF9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SAMD4BQ5PRF9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms