Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XKR4Q5GH76 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XKR4Q5GH76 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XKR4Q5GH76 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XKR4Q5GH76 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XKR4Q5GH76 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
XKR4Q5GH76 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
XKR4Q5GH76 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XKR4Q5GH76 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XKR4Q5GH76 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XKR4Q5GH76 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XKR4Q5GH76 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XKR4Q5GH76 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XKR4Q5GH76 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XKR4Q5GH76 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XKR4Q5GH76 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XKR4Q5GH76 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XKR4Q5GH76 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XKR4Q5GH76 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XKR4Q5GH76 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
XKR4Q5GH76 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XKR4Q5GH76 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XKR4Q5GH76 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
XKR4Q5GH76 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
XKR4Q5GH76 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XKR4Q5GH76 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
XKR4Q5GH76 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms