Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PAN3Q58A45 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms