Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.99
LIN52Q52LA3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIN52Q52LA3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIN52Q52LA3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIN52Q52LA3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIN52Q52LA3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIN52Q52LA3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIN52Q52LA3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIN52Q52LA3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIN52Q52LA3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIN52Q52LA3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIN52Q52LA3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIN52Q52LA3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LIN52Q52LA3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIN52Q52LA3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIN52Q52LA3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIN52Q52LA3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.5 ms