Protein–RNA interactions for Protein: Q504Q3

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN2Q504Q3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PAN2Q504Q3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAN2Q504Q3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms