Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GREB1Q4ZG55 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GREB1Q4ZG55 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GREB1Q4ZG55 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms