Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTXN3Q4LDR2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CTXN3Q4LDR2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CTXN3Q4LDR2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms