Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TYSND1Q2T9J0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TYSND1Q2T9J0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TYSND1Q2T9J0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms