Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPRED3Q2MJR0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPRED3Q2MJR0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPRED3Q2MJR0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms