Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ISXQ2M1V0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ISXQ2M1V0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms