Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SWI5Q1ZZU3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SWI5Q1ZZU3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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