Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Q1T7F1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Q1T7F1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q1T7F1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q1T7F1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q1T7F1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q1T7F1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q1T7F1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q1T7F1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q1T7F1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q1T7F1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q1T7F1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q1T7F1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q1T7F1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q1T7F1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q1T7F1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q1T7F1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q1T7F1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q1T7F1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q1T7F1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q1T7F1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q1T7F1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q1T7F1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q1T7F1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q1T7F1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q1T7F1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q1T7F1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q1T7F1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q1T7F1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Q1T7F1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q1T7F1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q1T7F1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q1T7F1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q1T7F1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q1T7F1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q1T7F1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q1T7F1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q1T7F1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q1T7F1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q1T7F1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q1T7F1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q1T7F1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q1T7F1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Q1T7F1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q1T7F1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q1T7F1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q1T7F1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q1T7F1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q1T7F1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Q1T7F1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q1T7F1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q1T7F1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Q1T7F1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q1T7F1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q1T7F1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q1T7F1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q1T7F1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q1T7F1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q1T7F1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q1T7F1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q1T7F1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q1T7F1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q1T7F1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q1T7F1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q1T7F1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q1T7F1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Q1T7F1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Q1T7F1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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