Protein–RNA interactions for Protein: Q17RP2

TIGD6, Tigger transposable element-derived protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD6Q17RP2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TIGD6Q17RP2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIGD6Q17RP2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIGD6Q17RP2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIGD6Q17RP2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIGD6Q17RP2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIGD6Q17RP2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TIGD6Q17RP2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIGD6Q17RP2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIGD6Q17RP2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIGD6Q17RP2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIGD6Q17RP2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TIGD6Q17RP2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIGD6Q17RP2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIGD6Q17RP2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIGD6Q17RP2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIGD6Q17RP2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIGD6Q17RP2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIGD6Q17RP2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIGD6Q17RP2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TIGD6Q17RP2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 266.8 ms