Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PPP1R3AQ16821 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PPP1R3AQ16821 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PPP1R3AQ16821 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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