Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NDUFA9Q16795 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
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NDUFA9Q16795 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
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NDUFA9Q16795 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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NDUFA9Q16795 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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NDUFA9Q16795 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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NDUFA9Q16795 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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NDUFA9Q16795 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NDUFA9Q16795 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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