Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TBR1Q16650 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
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