Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
LY6EQ16553 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LY6EQ16553 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms