Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PKN1Q16512 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PKN1Q16512 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PKN1Q16512 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
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