Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ALX1Q15699 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALX1Q15699 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
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