Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNHIT3Q15649 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNHIT3Q15649 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNHIT3Q15649 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNHIT3Q15649 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNHIT3Q15649 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNHIT3Q15649 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNHIT3Q15649 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNHIT3Q15649 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNHIT3Q15649 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNHIT3Q15649 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNHIT3Q15649 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNHIT3Q15649 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNHIT3Q15649 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNHIT3Q15649 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNHIT3Q15649 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNHIT3Q15649 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNHIT3Q15649 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNHIT3Q15649 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNHIT3Q15649 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNHIT3Q15649 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNHIT3Q15649 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNHIT3Q15649 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNHIT3Q15649 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNHIT3Q15649 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNHIT3Q15649 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNHIT3Q15649 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ZNHIT3Q15649 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms