Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SF3A2Q15428 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SF3A2Q15428 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SF3A2Q15428 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
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