Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PDK1Q15118 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDK1Q15118 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms