Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
R3HDM1Q15032 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
R3HDM1Q15032 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
R3HDM1Q15032 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
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