Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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ODF1Q14990 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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ODF1Q14990 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ODF1Q14990 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ODF1Q14990 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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