Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GINS1Q14691 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GINS1Q14691 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GINS1Q14691 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GINS1Q14691 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GINS1Q14691 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GINS1Q14691 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GINS1Q14691 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GINS1Q14691 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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