Protein–RNA interactions for Protein: Q14289

PTK2B, Protein-tyrosine kinase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2BQ14289 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTK2BQ14289 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTK2BQ14289 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTK2BQ14289 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTK2BQ14289 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTK2BQ14289 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTK2BQ14289 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTK2BQ14289 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTK2BQ14289 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTK2BQ14289 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTK2BQ14289 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTK2BQ14289 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTK2BQ14289 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTK2BQ14289 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTK2BQ14289 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTK2BQ14289 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTK2BQ14289 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTK2BQ14289 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTK2BQ14289 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTK2BQ14289 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTK2BQ14289 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTK2BQ14289 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTK2BQ14289 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTK2BQ14289 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTK2BQ14289 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTK2BQ14289 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTK2BQ14289 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTK2BQ14289 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTK2BQ14289 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms