Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCINQ13939 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCINQ13939 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCINQ13939 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCINQ13939 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCINQ13939 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCINQ13939 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCINQ13939 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCINQ13939 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCINQ13939 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCINQ13939 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCINQ13939 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCINQ13939 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCINQ13939 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCINQ13939 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCINQ13939 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCINQ13939 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCINQ13939 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCINQ13939 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCINQ13939 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCINQ13939 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCINQ13939 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCINQ13939 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCINQ13939 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCINQ13939 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCINQ13939 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCINQ13939 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCINQ13939 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCINQ13939 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCINQ13939 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCINQ13939 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCINQ13939 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCINQ13939 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCINQ13939 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCINQ13939 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCINQ13939 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCINQ13939 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCINQ13939 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCINQ13939 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCINQ13939 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCINQ13939 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCINQ13939 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCINQ13939 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCINQ13939 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCINQ13939 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCINQ13939 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCINQ13939 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCINQ13939 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCINQ13939 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCINQ13939 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCINQ13939 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCINQ13939 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCINQ13939 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCINQ13939 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCINQ13939 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCINQ13939 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCINQ13939 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCINQ13939 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCINQ13939 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCINQ13939 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCINQ13939 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCINQ13939 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCINQ13939 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCINQ13939 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCINQ13939 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCINQ13939 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCINQ13939 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCINQ13939 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCINQ13939 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCINQ13939 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCINQ13939 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCINQ13939 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCINQ13939 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCINQ13939 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCINQ13939 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCINQ13939 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCINQ13939 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCINQ13939 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCINQ13939 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCINQ13939 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCINQ13939 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCINQ13939 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCINQ13939 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCINQ13939 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCINQ13939 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCINQ13939 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCINQ13939 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCINQ13939 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCINQ13939 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCINQ13939 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCINQ13939 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCINQ13939 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCINQ13939 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCINQ13939 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCINQ13939 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCINQ13939 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCINQ13939 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCINQ13939 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCINQ13939 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCINQ13939 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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