Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPSNQ13702 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAPSNQ13702 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RAPSNQ13702 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RAPSNQ13702 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAPSNQ13702 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAPSNQ13702 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAPSNQ13702 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAPSNQ13702 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAPSNQ13702 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAPSNQ13702 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RAPSNQ13702 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RAPSNQ13702 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAPSNQ13702 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAPSNQ13702 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAPSNQ13702 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAPSNQ13702 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAPSNQ13702 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAPSNQ13702 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAPSNQ13702 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAPSNQ13702 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAPSNQ13702 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAPSNQ13702 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAPSNQ13702 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RAPSNQ13702 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAPSNQ13702 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAPSNQ13702 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAPSNQ13702 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAPSNQ13702 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAPSNQ13702 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAPSNQ13702 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAPSNQ13702 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAPSNQ13702 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAPSNQ13702 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RAPSNQ13702 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAPSNQ13702 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RAPSNQ13702 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RAPSNQ13702 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAPSNQ13702 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RAPSNQ13702 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RAPSNQ13702 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAPSNQ13702 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAPSNQ13702 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RAPSNQ13702 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAPSNQ13702 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAPSNQ13702 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAPSNQ13702 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAPSNQ13702 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAPSNQ13702 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAPSNQ13702 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAPSNQ13702 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAPSNQ13702 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RAPSNQ13702 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAPSNQ13702 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAPSNQ13702 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAPSNQ13702 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RAPSNQ13702 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RAPSNQ13702 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAPSNQ13702 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RAPSNQ13702 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAPSNQ13702 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAPSNQ13702 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RAPSNQ13702 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.28■■□□□ 1
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