Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR4Q13639 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTR4Q13639 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTR4Q13639 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
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