Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACACAQ13085 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACACAQ13085 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACACAQ13085 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACACAQ13085 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACACAQ13085 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACACAQ13085 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACACAQ13085 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACACAQ13085 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ACACAQ13085 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ACACAQ13085 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACACAQ13085 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACACAQ13085 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACACAQ13085 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACACAQ13085 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACACAQ13085 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACACAQ13085 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ACACAQ13085 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACACAQ13085 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACACAQ13085 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACACAQ13085 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACACAQ13085 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ACACAQ13085 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACACAQ13085 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACACAQ13085 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACACAQ13085 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ACACAQ13085 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ACACAQ13085 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms