Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FOXF2Q12947 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXF2Q12947 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXF2Q12947 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
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