Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF2Q12933 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRAF2Q12933 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAF2Q12933 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms