Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
BPTFQ12830 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BPTFQ12830 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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