Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNH2Q12809 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNH2Q12809 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
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