Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 RPS1AYLR441C 768 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 ATX2YOR079C 942 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 ERG10YPL028W 1197 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 LEE1YPL054W 906 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 ATG5YPL149W 885 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 CBP3YPL215W 1008 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 MLC2YPR188C 492 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 MRPL27YBR282W 441 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 YNL295WYNL295W 1575 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 IMA3YIL172C 1770 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 IMA4YJL221C 1770 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 MIP1YOR330C 3765 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 RGD2YFL047W 2145 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 TRM82YDR165W 1335 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 YCR022CYCR022C 345 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 UBC9YDL064W 474 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 GRX3YDR098C 858 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 PRP18YGR006W 756 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 GVP36YIL041W 981 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 ALG2YGL065C 1512 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 RRN7YJL025W 1545 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 APE4YHR113W 1473 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 NFS1YCL017C 1494 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 HEM1YDR232W 1647 nt6.07□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 VPS61YDR136C 573 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 HLR1YDR528W 1272 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 ISC10YER180C 804 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 TWF1YGR080W 999 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 CAP1YKL007W 807 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 GPX1YKL026C 504 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 SEC22YLR268W 645 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 YML034C-AYML034C-A 399 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 KSH1YNL024C-A 219 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 TSR4YOL022C 1227 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 YOR225WYOR225W 330 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 YPL185WYPL185W 396 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 YBR096WYBR096W 693 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 snR30snR30 606 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 TOS1YBR162C 1368 nt6.06□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 GEF1YJR040W 2340 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 CTA1YDR256C 1548 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 CIR2YOR356W 1896 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 YGR045CYGR045C 363 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 TPM2YIL138C 486 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 ATG27YJL178C 816 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 YNK1YKL067W 462 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 MAP2YBL091C 1266 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 CAF20YOR276W 486 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 PPT2YPL148C 522 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 DCC1YCL016C 1143 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 MAL12YGR292W 1755 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 MAL32YBR299W 1755 nt6.05□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 PXL1YKR090W 2121 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 RME1YGR044C 903 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 VMA21YGR105W 234 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 RHO5YNL180C 996 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 RPO26YPR187W 468 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 TRM13YOL125W 1431 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 RGD1YBR260C 2001 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 MKC7YDR144C 1791 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 RIO1YOR119C 1455 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 MMT2YPL224C 1455 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 YCL020WYCL020W 1317 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 YLL058WYLL058W 1728 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 BSC1YDL037C 987 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 YDR391CYDR391C 699 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 MND1YGL183C 660 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 RTT102YGR275W 474 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 ARP1YHR129C 1155 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 YKR073CYKR073C 321 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 FMP41YNL168C 780 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 PSF3YOL146W 585 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 RFC5YBR087W 1065 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 RPB5YBR154C 648 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-DR3Q12441 ACS1YAL054C 2142 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 EMP47YFL048C 1338 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 TFA1YKL028W 1449 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 TRM8YDL201W 861 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 PHO13YDL236W 939 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 FMP33YJL161W 543 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 EAF6YJR082C 342 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 PIR3YKL163W 978 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 YOR366WYOR366W 354 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 SIT1YEL065W 1887 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 MSN4YKL062W 1893 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 RPN11YFR004W 921 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 BET1YIL004C 429 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 FLX1YIL134W 936 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 AIM24YJR080C 1185 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 TSA1YML028W 591 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 POR1YNL055C 852 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 YPR127WYPR127W 1038 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 UBX3YDL091C 1368 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 PEX31YGR004W 1389 nt6.01□□□□□ -1.45
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