Protein–RNA interactions for Protein: Q10713

PMPCA, Mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCAQ10713 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMPCAQ10713 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMPCAQ10713 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms